包头医学院第一附属医院神经外科是内蒙古自治区领先学科、内蒙古自治区神经外科专科联盟主委单位、中国医师协会内镜颅底外科技术培训中心、内蒙古自治区草原人才创新团队、内蒙古自治区骨组织再生与损伤修复工程技术研究中心、包头医学院神经外科疾病研究所、国家神经系统疾病临床研究中心首都医科大学附属医院北京天坛医院神经系统疾病专科联盟成员单位、首都医科大学宣武医院国家心脑血管病联盟成员单位。科室于上世纪60年代开展神经外科工作，经过几代人的不懈努力，目前已发展成为内蒙古自治区神经外科领域综合实力最强的学科之一。
目前科室分为：神经介入、神经血管、神经肿瘤、神经功能、神经内镜、神经重症等诸多亚专业组，专业细化，学科联动。具备显微神经外科、介入神经外科、内镜神经外科和立体定向功能神经外科技术和装备。包头医学院神经外科研究所下设两个实验室：1、神经外科显微实验室；2、神经外科实验室。
科室手术包括：神经介入：动脉瘤栓塞术、动静脉畸形栓塞术、颈内动脉海绵窦瘘栓塞术、颈内动脉、锁骨下动脉、椎动脉、基底动脉、大脑中动脉狭窄、球囊扩张或支架扩张置入术、急诊动脉溶栓、取栓术等手术；神经血管：动脉瘤夹闭术、动静脉畸形团块切除术、硬脑膜动静脉瘘结扎切断术、颈内动脉内膜剥脱术、烟雾病、大脑前、中、后缺血性脑病、颅内外血管搭桥术；神经肿瘤：包括嗅沟、蝶骨平台、鞍区、海绵窦、蝶骨嵴、岩尖、斜坡、桥小脑角、枕骨大孔、侧脑室及第三、四脑室肿瘤切除术以及脑干、高颈段、硬脊膜内外病变的手术切除；神经功能：包括癫痫患者的脑电筛查、癫痫的定位与手术治疗、三叉神经痛、面肌痉挛、舌咽神经痛的手术治疗；神经内镜：脑积水、经侧脑室、三脑室底造瘘术、经鼻蝶入路垂体瘤切除术、鞍底脑膜瘤切除术、脊索瘤切除术、以及高血压脑出血的内镜下治疗。
